GMP净化车间就是指符合GMP质量安全管理体系要求的车间。

车间，净化厂房墙、顶板材一般多采用50mm厚的夹芯彩钢板制造，其特点为美观、刚性强。圆弧墙角、门、窗框等一般采用专用氧化铝型材制造。

GMP净化车间为了防止交叉感染，清扫净化车间设施的工具均应按产品特点、工艺要求、空气洁净度级别的不同分别专用，垃圾装入防尘袋中拿出。车间的清扫必须在上下班前、生产工艺操作结束后进行；清扫要在净化车间空调系统运行中进行；清扫工作结束后，净化空调系统要继续运行，直到恢复规定的洁净级别为止，开机运行时间一般不短于该车间的自净时间。使用的消毒剂要定期更换，以防止微生物产生耐药性。大的物件搬进车间时，先要在一般环境中用吸尘器进行初步的吸尘净化，然后再准进入净化车间内，用洁净室真空吸尘器或擦拭方法进一步处理；在车间净化系统停止运行期间，不允许把大的物件搬进净化车间。

为了更好的控制净化车间不受污染，还有一种灭菌式传递窗。为了防止病菌带入净化车间内，传递窗中装有紫外灯，开窗放入物件后，关窗并开紫外灯，照射至少30分钟后再开窗取出。为弥补机械式传递窗会带入污染空气的缺陷，净化车间除使用气闸式传递窗外，还能采用封闭可取式。将要传递的物品放入洁净盒中装好，拿到封闭可取式传递窗的开关装置上，按动电钮，洁净盒底板自行打开，物品落出，再被取入洁净室。

层流传递窗是一种比较先进的净化车间辅助设备，主要用于不同等级不同压力的净化车间之间传递小物件的设备。这种传递窗，一方面起到气闸的作用，不让净化车间中高压被泄压，另一方面在传递过程中实现自净效果，以确保进入洁净区的物品的洁净度，减少物件传递带来的交叉污染。