固相萃取装置是从复杂基质中分离目标分析物的工具，各种色谱吸附剂的可用性使得能够根据分析物和基质的特定化学成分进行有针对性的方法。SPE还能够富集或预浓缩样品中的分析物。将固相萃取装置分析物浓度与用于测量它们的方法相匹配。鉴于这些的能力，固相萃取装置被认为是分析样品的设备。
使用真空歧管上的滤芯的SPE需要适当的培训，必须注意实时保持适当的液体流量。每个技术人员每天可处理的样品数量限制为30个。固相萃取装置如果需要富集，则需要进行样品干燥步骤，这会降低产量。
移液管吸头，药筒或96孔板的平行方法增加了样品数量，平行液体流动在管与管之间或从井到井变化很大。平行流量的可变性增加导致分析物回收的额外变化，需要使用内部标准并接受较低质量，SPE吸附剂上的样品/溶剂流动不是移液样品/溶剂到每个孔。并行仅适度增加样品通量，固相萃取仪但也由于更多数量的移液步骤而导致人为错误的概率。
为了提高固相萃取仪通量，可以将并联方法与机器人结合进行移液，然而，在这个双工作流程过程中，结果的质量较低。另一个缺点是机器人，从结果的角度来看，这似乎反映了速度，成本，质量，其中三者中的任何一个的收益都会从其他两个中获益。突破速度，成本，质量要对设备进行根本性改变，固相萃取装置以便仅使用现有的分析仪器而不是高成本的机器人实现自动化和更高质量。
自动化固相萃取仪使用自动进样器注射器进行滤芯调节，样品上样和废物容器上的样品清洗。注射器用于在干净的小瓶或孔上进行洗脱，并且将用过的药筒丢弃在不同的废物容器中。注射器混合新洗脱的样品后，完成用于测量样品。实现精确的色谱分离，样品预浓缩，固相萃取仪稳定的操作和自动化。
