考虑到食品检测的不确定性，现阶段检测标准的执行难免会出现各种问题。然后我们国内的离子色谱仪生产厂家上海历元总结了离子色谱仪在食品检测中的应用，包括硝酸盐、低聚半乳糖和兽药残留的检测。
离子色谱法测定食品中的亚硝酸盐和硝酸盐
在检测食品中的亚硝酸盐和硝酸盐，如婴儿米糊、火腿肠等样品时，国内离子色谱仪制造商上海历元为客户积累了丰富的问题处理经验，针对不同类型的样品有一系列详细的解决方案。结合紧凑型离子色谱的优点，提高了亚硝酸根检测的灵敏度。类似的方法也可用于检测溴酸盐、碘化物等。
离子色谱-质谱可用于检测氨基糖苷类兽药残留。
随着检测法规的完善，各种质谱方法在食品检测中的应用越来越多。与传统液相相比，离子色谱仪在分离极性强、易电离的农残和动物残方面有天然优势，抑制器具有脱盐能力，可以更好地与质谱兼容。
依托离子色谱-质谱联用的方法，使用氨基糖苷类抗生素分离柱，使用离子色谱电解膜抑制器去除的离子对试剂，进入质谱进行检测，分析时间可缩短50%，同时灵敏度可大大提高。
离子色谱法测定乳制品中的低聚半乳糖
因为低聚半乳糖的含量是根据检测出的低聚半乳糖含量来计算的，而奶粉中50%的乳糖酶也会产生半乳糖，所以无法准确检测出低聚半乳糖的含量。婴幼儿配方奶粉的生产商需要进行质量控制。
利用分离能力强的糖柱，以低聚半乳糖为对照品，可以直接检测乳制品中低聚半乳糖的含量。
