菌落计数器广泛用于食品、饮料、药品、生物制品、化妆品、卫生用品、饮用水、生活污水、工业废水、临床标本中细菌数的检验。是各级隆重防疫站、环境监测站、食品卫生监督检验所、医院、生物制品所、药检所、商检局、食品厂、饮料厂、化妆品厂、日化厂及大专院校、科研单位实验室的仪器。
菌落计数器的常见计数方法：
1.计数器测量方法
打算用计数。取一定体积的样品细胞悬液放在的计数室中，用显微镜观察和计数。由于计数室的体积是固定的（o.1mm3），因此样品中细菌的数量可以根据计数器规模中的细菌数量进行计算，该方法简便易行，可马上得到结果（该方法不仅适用于细菌计数，还适用于细菌计数。计数酵母和霉菌孢子）。
2.电子计数器计数法
电子计数器的工作原理是测量小孔中液体的电阻变化。小孔只能穿越一个单元格。当细胞通过小孔时，电阻显着增加，形成脉冲并自动纪录在电子记录装置上。此方法的测量结果相对较好，但只能识别微粒的尺寸，无法识别区分是不是是细菌。因此，细菌悬浮液中不需要碎片。
3.比浊法
比浊法是根据细菌悬浮液的透光率间接确定细菌的数量，在一定范围内细菌悬浮液的浓度与透射率成反比，与光密度成正比，因此光电比色计测定菌液可使用光密度（OD值）指示样品中细菌溶液的浓度，该方法简便，迅速，但只能检测到包含大量细菌的悬浮液，并赢得相对浓度细菌数量。对于色调太深的样品，无法使用此方法进行测定。
