由于存放，运输等过程可能将色谱柱管玷污或损坏，使用前应将色谱柱进行试漏与清洗。
        试漏的操作方法很简单，只要将柱管全部浸入水中，将其出口填死，入口通入氮气，在高于使用的操作压力下，以管壁没有气泡冒出为合格。
       清洗的方法，因管柱的材料不同而异。
1、玻璃柱管可注入清洗液浸泡两次（必要时使用温热的清洗液，效果更好），然后用自来水冲至中性，再用蒸馏水清洗。清洁的玻璃管内壁不应挂有水珠，否则还要用温热的清洗液洗涤，洗后用自来水冲至中性，再用蒸馏水清洗，烘干后备用。
2、对于不锈钢柱管，可用5-10%的热碱水溶液抽洗4-5次，以出去内壁的油污，然后用自来水冲洗至中性，再用蒸馏水清洗，烘干后备用。
3、对于铜柱管，可采用10%的盐酸浸泡，并用水泵抽洗，直至抽洗液中无金属铜锈或其他悬浮杂质为止，然后用自来水冲洗至中性，再用蒸馏水清洗，烘干后备用。
4、对于已经用过的色谱柱，需要重换其固定相时，柱管也应当用相应的溶剂（如、乙醇、热碱液）依次洗涤，自来水冲至中性，然后用蒸馏水清洗，以除去柱管中的载体粉末及粘附在壁管上的固定液膜，烘干后备用。