危险废物对生态环境的危害是多方面，主要通过以下途径对水体、大气和土壤造成污染。

（1）对水体的污染，危险废物随天然降水径流流入江、河、湖、海，污染地表水；危险废物中的有害物质随渗滤液渗入土壤，使地下水污染；若将危险废物直接排入江、河、湖、 海或者通过打井排入地下水系， 会造成更为严重的污染，且多为不可逆的。

（2）对大气的污染，危险废物本身蒸发、升华及有机废物被微生物分解而释放出的有害气体会直接污染大气；危险废物中的细颗粒、粉末随风飘逸，扩散到空气中，会造成大气粉尘污染；在危险废物不规范的运输、贮存、利用及处置过程中，产生的有害气体、粉尘也会直接或间接排放到大气中污染环境。

（3）对土壤的污染，危险废物的粉尘、颗粒随风飘落在土壤表面，而后进入土壤中污染土壤；液体、半固态危险废物在贮存过程中或抛弃后洒漏地面、渗入土壤，有害成分混入土壤中会继续迁移从而导致地下水污染或通过生物富集作用而进入食物链等。