全自动凝胶成像分析系统在生物实验室和各类科研机构的应用也日益广泛，已成各科实验的重要辅助手段。通过对凝胶电泳后图像的高效的捕捉与深入的分析，该系统已广泛地在分子生物学、遗传学、蛋白质组学等领域的基础研究、临床诊断以及药物的研发等方面都得到了广泛的应用，尤其在DNA、RNA和蛋白质的分离和定量的分析中具有十分重要的意义。
采用对其各主要的软、硬件的整合和手段，
全自动的凝胶成像分析系统的基本框构成由以下几个主要的部分组成：
1.成像设备：通过高精度的CCD或CMOS摄像头的成像设备对凝胶中的荧光或颜色的信号的实时的动态的采集和将其高效的转化为数字的图像，对其的成像和分析具有了极大的方便性和灵活性。
2.光源：根据所需的染料或标记的特异性，我们往往需要配备相应的波长的光源，如紫外灯或荧光灯等对其进行成像。
3.凝胶槽：通过将电泳后的凝胶均匀的放置在专门的凝胶槽中，并配有恒温的装置，有效的避免了成像过程中对样品的热量的不良影响，从而更好的使得所得的图像具有较高的清晰度和真实性。
4.计算分析软件：依托于对捕获的图像的深入的处理、分析和量化的计算分析软件不仅能对带状和条带的自动的识别，而且能对其所带的信息的定量的分析。
5.操作界面：基于优雅的操作界面不仅使得用户能够轻松地输入所需的参数和参数的取值范围，更为重要的是使得用户能够方便地启动程序并快速地查看分析的结果。
