分光光度法中比色皿洁净与否是影响测定准确度的因素之一。因此，必须重视选择正确的洗净方法。
每次使用完毕的比色皿，一般先用自来水冲洗，再用蒸馏水冲洗三次，倒置于干净的滤纸上晾干，然后存放于比色皿盒中。如果比色皿被有机物污染，宜用盐酸-乙醇(1+2)混合液浸洗，也可用相应的有机溶剂浸泡洗涤。
如：油脂污染可用石油醚浸洗，铬天青显色剂污染可用硝酸(1+2)浸洗等。比色皿不可用碱液洗涤，也不能用硬布、毛刷刷洗。
含有能腐蚀玻璃物质的溶液，如氟化物的高浓度溶液不可放人比色皿中。含氟离子浓度低的溶液也不宜在皿中久置。比色皿质地较脆，石英皿尤甚，使用时动作要轻，切勿摔碰。市场面上一般使用的石英比色皿均为石英粉烧接的，超声波清洗， 洗比色皿清洗时毛面朝下。
